Omdat innovaties in schone techniek vaak vanuit meerdere (top)sectoren samenkomen kan het in Nederland nog wel eens lastig zijn om overheidsfinanciering te vinden in de negen topsectoren. En helaas is er tot op heden ook nog geen actieagenda schone techniek zoals die er wel is voor bijvoorbeeld ICT.
Echter zijn er meer overheden dan alleen de nationale. Zo is er ook de Europese Unie en die hebben een breder pallet dan de negen topsectoren. Hieronder een overzicht van de financieringsmogelijkheden voor het Eco-innovation in de Europese Unie.